wurde 1947 in Berlin geboren. Er studierte Erwerbsgartenbau an der Technischen Universität Berlin und promovierte 1974 zum Dr. agr. an der Technischen Universität München. Von 1976 bis 1987 war er an der Universität Bayreuth tätig, wo er 1986 für das Fach Bodenkunde habilitierte. 1987 folgte er der Berufung an die Technische Universität Berlin, wo er seitdem als Leiter des FG Abfallbelastung der Landschaft am Institut für Landschaftsbau (heute Institut für Ökologie) tätig ist.
Seine Forschungsschwerpunkte liegen in den Bereichen Bodenmikrobiologie, Bodensanierung und ökotoxikologische Bewertung von Böden. 1995 wurde Berndt-Michael Wilke zum Unesco Chair Holder am Institute for Applied Ecology der chinesischen Akademie der Wissenschaften in Shenyang ernannt. 1997 erfolgt die Berufung in den Wissenschaftlichen Beirat "Bodenschutz" beim Bundesministerium für Umwelt, Naturschutz und Reaktorsicherheit, dem er bis 2005 angehörte. Im September 2007 wurde er zum Vizepräsidenten der Deutschen Bodenkundlichen Gesellschaft gewählt.
Seit 1988 ist Prof. Wilke aktiv im Bereich der Normung von Bodenuntersuchungsverfahren, u. a. als Vorsitzender der ISO-Arbeitsgruppen "Mikrobiologie" und "Ökotoxikologie" des ISO/TC 190 "Soil Quality". Im Bundesverband Boden e. V. ist er seit 2003 Vorsitzender der Fachgruppe 4 und leitet als Obmann den Fachausschuss "Biologische Bewertung von Böden". Außerdem ist er Mitarbeiter im DECHEMA-Arbeitskreis "Boden/Grundwasser".
Neben seiner Herausgebertätigkeit des Handbuchs Bodengefährdende Stoffe ist Prof. Wilke Redaktionsmitglied des "Handbuch der Bodenuntersuchung", Leiter der Schriftenreihe "Landschaftsentwicklung und Umweltplanung" sowie Mitautor des "Lehrbuchs der Bodenkunde - Scheffer-Schachtschabel" und Mitherausgeber der Loseblattsammlung "Bodengefährdende Stoffe".